二氧化碳激光适合于外阴、肛门周围等表浅较小的疣体治疗，一般1次即可使疣体脱落。较大尖锐湿疣因血供丰富使二氧化碳激光治疗困难且极易出血，甚至无法治疗，治疗后容易复发。二氧化碳激光治疗尖锐湿疣也存在如下缺点。
（l）二氧化碳激光治疗时对机体可能是一种刺激，从而激发乳头瘤病毒亚临床感染状态转为临床感染状态，一般认为尖锐湿疣的亚临床感染病灶位于疣体周围2cm 范围内。
（2）二氧化碳激光烧灼疣体时，可能因高温引起含有乳头瘤病毒颗粒蒸汽并散落在疣体周围而接种致复发。
（3）二氧化碳激光治疗操作过程中时烧灼的深度有未达到尖锐湿疣病理意义上的真皮乳头层。在治疗前可进行阴道镜检查或醋酸白试验确定烧灼范围，应略欠于疣体，从而在治疗过程中去除亚临床感染皮损。在此需指出的是，在治疗期间，性伴侣也要同时接受检查或治疗。
